Обновить
14
Danil Vishnyakov@FeLkan

Bioinformatics/Data Science/DevOps

1
Рейтинг
14
Подписчики
Отправить сообщение

Data-driven корова: как мы строим SaaS для геномной селекции и решаем проблемы «грязных» данных в агротехе

Уровень сложностиПростой
Время на прочтение5 мин
Охват и читатели6.9K

Большинство данных на фермах оседает в Excel-таблицах и тетрадках зоотехников. Вместе с командой Genome AI (акселератор Talent Hub ИТМО и Napoleon IT) разбираемся, как машинное обучение превращает генетический «шум» в прогнозы продуктивности. В статье — про гибридные модели (CatBoost + PyTorch), работу с SNP-маркерами, кривые лактации и то, зачем корове цифровой двойник. Без абстракций — только код на R, визуализации и архитектура пайплайна.

Читать далее

Загрузка в UEFI/BIOS без горячих клавиш: консольные методы для Windows и Linux

Уровень сложностиПростой
Время на прочтение5 мин
Охват и читатели16K

Вам когда-нибудь нужно было зайти в BIOS или UEFI, чтобы сменить порядок загрузки, включить виртуализацию или проверить оборудование? Многие пользователи знают лишь один способ — в первые секунды после включения компьютера нажать DelF2 или другую «волшебную» клавишу. Но что делать, если клавиатура не работает, используется удалённое подключение, или вы просто не успеваете нажать нужную кнопку из-за быстрой загрузки системы?

Оказывается, на современных операционных системах можно программно перезагрузиться прямо в интерфейс прошивки, используя лишь командную строку или терминал. В этой статье мы рассмотрим, как это сделать в Windows, Linux и выясним, какие возможности есть в macOS.

Читать далее

Как победить рецидив: путеводитель по полю битвы с онкологией

Уровень сложностиПростой
Время на прочтение42 мин
Охват и читатели55K

Итак, дорогие читатели! Сейчас я обучаюсь на 4 курсе (бакалавр) на программиста (направление: Информатика и вычислительная техника) в семестре столкнулся с очень интересным исследовательским проектом, связанным с биоинформатикой! Вместе с заказчиком мы ему дали научное название: «Снижение рисков развития рецидива злокачественного новообразования» и отправляем в долгое плавание!

На примере проекта‑исследования мы хотим рассказать: где искать медицинские данные? Какого это с ними работать? Как правильно подходить к исследовательской задаче и многое другое. Вы даже сами сможете повторить наши результаты, и я уверен, что у вас получится даже лучше.

Что приходит на ум, когда слышите слово «рецидив»? Правильно, возвращение того, от чего вы уже вроде как избавились. Для заболевших пациентов это слово внушает тревогу, а в онкологии и вовсе звучит как зловещий колокол. Но не бойтесь: сегодня мы не только посмеемся над этим монстром, но и узнаем, как ему дать отпор. Спойлер: с помощью науки и чуточки аналитики.

Читать далее

Обзор недавно выпущенной модели Evo для анализа геномных данных

Уровень сложностиПростой
Время на прочтение6 мин
Охват и читатели2.7K

Давайте представим, что вы начинающий или опытный биоинформатик, или "простой смертный", который хочет углубиться в анализ биологических данных. Спойлер: биоинформатики тоже смертные! Зачастую, не у каждого хватает ценного времени на проверку огромных последовательностей геномных данных, будь то поиск различных мутаций или прогнозирование структуры белков на основе последовательности аминокислот.

Но не переживайте, в этом вам поможет искусственный интеллект! Да, тот самый ИИ, который чуть ли не через каждую минуту обещает изменить мир и избавить нас от всех проблем — от покупки продуктов до поиска идеальных генетических маркеров для рака. Так вот, давайте разберемся, как ИИ может помочь нам, бедным исследователям, быстро и эффективно работать с данными, которые, казалось бы, невозможно обработать, даже за целую жизнь.

Читать далее

Когда «тихая» ДНК громче гена: как избыточная ДНК регулирует экспрессию, ничего не делая

Уровень сложностиСредний
Время на прочтение6 мин
Охват и читатели4.6K

Мир биоинформатики полон загадок: что такое избыточная ДНК, почему она занимает половину генома, и как это вообще работает? Кому-то может показаться, что некодирующая ДНК — это просто «балласт», но на деле это, как если бы в вашем коде была сложная инфраструктура, которая отвечает за оптимизацию и поддержание всей системы.

Сегодня мы с вами разберёмся, как эта загадочная некодирующая ДНК умудряется контролировать экспрессию генов, ничего при этом не кодируя. А чтобы вы не заскучали, добавим капельку Python, ведь кода много не бывает!

Читать далее

SpyderIDE: Твоя новая «восьмилапая» подруга для Python-разработки

Уровень сложностиПростой
Время на прочтение8 мин
Охват и читатели28K

Дорогие друзья, порадуемся тому факту, что даже в мире IDE есть свои пауки. Не те, что заползают в ваш код, добавляя баги, а настоящие спасатели программного хаоса. Сегодня речь пойдет о SpyderIDE, любимице научного сообщества и тех, кто слишком увлечен pandas и numpy, чтобы замечать окружающий мир.

Читать далее

Информация

В рейтинге
2 009-й
Откуда
Бишкек, Кыргызстан, Кыргызстан
Дата рождения
Зарегистрирован
Активность

Специализация

Ученый по данным, ML разработчик
Средний
От 200 000 ₽
Python
SQL
Linux
Базы данных
Rust
Разработка программного обеспечения
Алгоритмы и структуры данных
Объектно-ориентированное проектирование
Прикладная математика
Java